Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHX1

PUF60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60Q9UHX1 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PUF60Q9UHX1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PUF60Q9UHX1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms