Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO40Q9UH90 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FBXO40Q9UH90 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FBXO40Q9UH90 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms