Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC31.01■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC31■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC31■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
IFT172Q9UG01 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
IFT172Q9UG01 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms