Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
REREQ9P2R6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC32.45■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
REREQ9P2R6 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC32.37■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
REREQ9P2R6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
REREQ9P2R6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms