Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HACD3Q9P035 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HACD3Q9P035 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms