Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY35

CLDND1, Claudin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDND1Q9NY35 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDND1Q9NY35 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDND1Q9NY35 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDND1Q9NY35 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms