Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXL9

MCM9, DNA helicase MCM9, humanhuman

Predictions only

Length 1,143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM9Q9NXL9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
MCM9Q9NXL9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
MCM9Q9NXL9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM9Q9NXL9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM9Q9NXL9 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM9Q9NXL9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM9Q9NXL9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM9Q9NXL9 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MCM9Q9NXL9 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms