Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQT6

FSCN3, Fascin-3, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN3Q9NQT6 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FSCN3Q9NQT6 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC21.33■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.3■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FSCN3Q9NQT6 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms