Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBU9

POPDC2, Popeye domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POPDC2Q9HBU9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
POPDC2Q9HBU9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
POPDC2Q9HBU9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms