Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubxn11Q9D572 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubxn11Q9D572 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms