Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gcc1Q9D4H2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Gcc1Q9D4H2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gcc1Q9D4H2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms