Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Y8

Mrpl52, 39S ribosomal protein L52, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl52Q9D0Y8 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Mrpl52Q9D0Y8 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms