Protein–RNA interactions for Protein: Q9CW03

Smc3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc3Q9CW03 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc3Q9CW03 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc3Q9CW03 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc3Q9CW03 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc3Q9CW03 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc3Q9CW03 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc3Q9CW03 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc3Q9CW03 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc3Q9CW03 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc3Q9CW03 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Smc3Q9CW03 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Smc3Q9CW03 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Smc3Q9CW03 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms