Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ68

1700029P11Rik, RIKEN cDNA 1700029P11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029P11RikQ9CQ68 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
1700029P11RikQ9CQ68 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
1700029P11RikQ9CQ68 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms