Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC46A2Q9BY10 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SLC46A2Q9BY10 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms