Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA7

TSSK1B, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK1BQ9BXA7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TSSK1BQ9BXA7 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TSSK1BQ9BXA7 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms