Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SMIM2Q9BVW6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMIM2Q9BVW6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms