Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV90

SNRNP25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25Q9BV90 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNRNP25Q9BV90 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SNRNP25Q9BV90 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms