Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TRIM56Q9BRZ2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TRIM56Q9BRZ2 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 896.5 ms