Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CPPED1Q9BRF8 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CPPED1Q9BRF8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CPPED1Q9BRF8 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CPPED1Q9BRF8 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CPPED1Q9BRF8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CPPED1Q9BRF8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CPPED1Q9BRF8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CPPED1Q9BRF8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CPPED1Q9BRF8 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CPPED1Q9BRF8 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CPPED1Q9BRF8 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CPPED1Q9BRF8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CPPED1Q9BRF8 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CPPED1Q9BRF8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CPPED1Q9BRF8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CPPED1Q9BRF8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms