Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
FYCO1Q9BQS8 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC33.98■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FYCO1Q9BQS8 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
FYCO1Q9BQS8 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms