Protein–RNA interactions for Protein: Q99N95

Mrpl3, 39S ribosomal protein L3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl3Q99N95 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Mrpl3Q99N95 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl3Q99N95 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms