Protein–RNA interactions for Protein: Q99567

NUP88, Nuclear pore complex protein Nup88, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP88Q99567 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NUP88Q99567 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NUP88Q99567 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NUP88Q99567 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.5 ms