Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CsprsQ99388 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CsprsQ99388 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms