Protein–RNA interactions for Protein: Q96FE5

LINGO1, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain-containing nogo receptor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINGO1Q96FE5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINGO1Q96FE5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC21.32■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.31■■□□□ 1
LINGO1Q96FE5 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 211 ms