Protein–RNA interactions for Protein: Q96EK2

PHF21B, PHD finger protein 21B, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF21BQ96EK2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PHF21BQ96EK2 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHF21BQ96EK2 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms