Protein–RNA interactions for Protein: Q96A05

ATP6V1E2, V-type proton ATPase subunit E 2, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E2Q96A05 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP6V1E2Q96A05 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP6V1E2Q96A05 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms