Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Csmd1Q923L3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Csmd1Q923L3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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