Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tubb6Q922F4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tubb6Q922F4 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms