Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE73

Cul7, Cullin-7, mousemouse

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul7Q8VE73 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Cul7Q8VE73 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cul7Q8VE73 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cul7Q8VE73 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms