Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDW7

FAT3, Protocadherin Fat 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAT3Q8TDW7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FAT3Q8TDW7 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FAT3Q8TDW7 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FAT3Q8TDW7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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FAT3Q8TDW7 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FAT3Q8TDW7 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
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FAT3Q8TDW7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
FAT3Q8TDW7 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FAT3Q8TDW7 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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