Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
C17orf47Q8NEP4 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
C17orf47Q8NEP4 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms