Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFG9

C1rb, Complement C1r-B subcomponent, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1rbQ8CFG9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
C1rbQ8CFG9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
C1rbQ8CFG9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms