Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCM6

Timm21, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim21, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm21Q8CCM6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Timm21Q8CCM6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Timm21Q8CCM6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms