Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8T8

Tsr2, Pre-rRNA-processing protein TSR2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr2Q8C8T8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tsr2Q8C8T8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tsr2Q8C8T8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tsr2Q8C8T8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms