Protein–RNA interactions for Protein: Q80TT8

Cul9, Cullin-9, mousemouse

Predictions only

Length 1,865 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul9Q80TT8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Cul9Q80TT8 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Cul9Q80TT8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Cul9Q80TT8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms