Protein–RNA interactions for Protein: Q80SS5

Ifna12, Interferon alpha-12, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna12Q80SS5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ifna12Q80SS5 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ifna12Q80SS5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms