Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Z2

RD3, Protein RD3, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3Q7Z3Z2 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RD3Q7Z3Z2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.32■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.31■■□□□ 1
RD3Q7Z3Z2 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.1 ms