Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS46

Pdcd11, Protein RRP5 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd11Q6NS46 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pdcd11Q6NS46 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Pdcd11Q6NS46 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Pdcd11Q6NS46 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms