Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm20854Q62461 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm20854Q62461 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm20854Q62461 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm20854Q62461 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20854Q62461 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20854Q62461 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20854Q62461 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20854Q62461 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm20854Q62461 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm20854Q62461 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm20854Q62461 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm20854Q62461 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm20854Q62461 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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