Protein–RNA interactions for Protein: Q61136

Prpf4b, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4bQ61136 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prpf4bQ61136 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Prpf4bQ61136 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Prpf4bQ61136 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Prpf4bQ61136 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Prpf4bQ61136 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms