Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW36

FOCAD, Focadhesin, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOCADQ5VW36 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FOCADQ5VW36 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
FOCADQ5VW36 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms