Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCJ1

Rapgef6, Rap guanine nucleotide exchange factor (GEF) 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef6Q5NCJ1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Rapgef6Q5NCJ1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Rapgef6Q5NCJ1 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rapgef6Q5NCJ1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms