Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGF2

Fam107b, Protein FAM107B, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam107bQ3TGF2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Fam107bQ3TGF2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Fam107bQ3TGF2 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms