Protein–RNA interactions for Protein: Q16594

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF9Q16594 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TAF9Q16594 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TAF9Q16594 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms