Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
GRIK4Q16099 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
GRIK4Q16099 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
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