Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NKX1-1Q15270 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NKX1-1Q15270 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
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