Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
SMC1AQ14683 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMC1AQ14683 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
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