Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 ATG13YPR185W 2217 nt2.76□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YDL180WYDL180W 1644 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 FUN12YAL035W 3009 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YBL065WYBL065W 345 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 NAM9YNL137C 1461 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 KAP95YLR347C 2586 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 SSE2YBR169C 2082 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 PFK26YIL107C 2484 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 PMR1YGL167C 2853 nt2.75□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 PUB1YNL016W 1362 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 CHK1YBR274W 1584 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 FUN30YAL019W 3396 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 MEK1YOR351C 1494 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 ENT5YDR153C 1236 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 RSF1YMR030W 1131 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 PUF2YPR042C 3228 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 RCY1YJL204C 2523 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 MDM1YML104C 3384 nt2.74□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 COM2YER130C 1332 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 PRM2YIL037C 1971 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 RPS18AYDR450W 441 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 RAI1YGL246C 1164 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 PAN5YHR063C 1140 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 MRPL20YKR085C 588 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 TVP18YMR071C 504 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 SNO1YMR095C 675 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YPL088WYPL088W 1029 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YPL107WYPL107W 747 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 POC4YPL144W 447 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 MRPL37YBR268W 318 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 GYP6YJL044C 1377 nt2.73□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 STE14YDR410C 720 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 APA2YDR530C 978 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 TOS8YGL096W 831 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 TFC4YGR047C 3078 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 COX18YGR062C 951 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 ERG11YHR007C 1593 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 SDH3YKL141W 597 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 DDI3YNL335W 678 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 TRM13YOL125W 1431 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 TCM62YBR044C 1719 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 CTR86YCR054C 1692 nt2.72□□□□□ -1.97
ATG41Q12048 CDH1YGL003C 1701 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 FLO5YHR211W 3228 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 SMP3YOR149C 1551 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 IMP4YNL075W 873 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 TMC1YOR052C 453 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 BUD21YOR078W 645 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 TAF3YPL011C 1062 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 CKS1YBR135W 453 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 SPT16YGL207W 3108 nt2.71□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 SUC2YIL162W 1599 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 YHI9YHR029C 885 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 PSR1YLL010C 1284 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 CDC73YLR418C 1182 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 PRX1YBL064C 786 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 STT4YLR305C 5703 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 SIR1YKR101W 1965 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 UBP5YER144C 2418 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 ERB1YMR049C 2424 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 SPO71YDR104C 3738 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 YKL050CYKL050C 2769 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 SRC1YML034W 2505 nt2.7□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 TGL1YKL140W 1647 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 CDC26YFR036W 375 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 COS12YGL263W 1143 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 YGR015CYGR015C 987 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 TIM21YGR033C 720 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 QCR10YHR001W-A 234 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 YKE4YIL023C 1041 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 HTA2YBL003C 399 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 CEP3YMR168C 1827 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 YLR278CYLR278C 4026 nt2.69□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 SPS2YDR522C 1509 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 NPL4YBR170C 1743 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 TAO3YIL129C 7131 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 SQS1YNL224C 2304 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 YEL028WYEL028W 462 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 JLP1YLL057C 1239 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 YNR071CYNR071C 1029 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 RPA43YOR340C 981 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 HFD1YMR110C 1599 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 HEH2YDR458C 1992 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 EPL1YFL024C 2499 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 SEC6YIL068C 2418 nt2.68□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 ITC1YGL133W 3795 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 FRE4YNR060W 2160 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 CNA1YLR433C 1662 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 ORC4YPR162C 1590 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 ESL1YIL151C 3357 nt2.67□□□□□ -1.98
ATG41Q12048 COS7YDL248W 1152 nt2.67□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.3 ms