Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Crisp3Q03402 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Crisp3Q03402 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms